Περιεχόμενο
Η δομή του δίκλωνου ϋΝΑ είναι καθολική σε όλα τα ζωντανά κύτταρα, αλλά υπάρχουν διαφορές στις μεθόδους για την εξαγωγή γονιδιωματικού ϋΝΑ από ζωικά και φυτικά κύτταρα. Αν και το γονιδιωματικό DNA ζει στον πυρήνα των κυττάρων, η ποσότητα και η καθαρότητα του εξαγόμενου DNA εξαρτάται από τον τύπο και το μέγεθος του κυττάρου. Για παράδειγμα, ορισμένα κύτταρα περιέχουν περισσότερο DNA και ακαθαρσίες από άλλα. Διαβάστε παρακάτω για να μάθετε περισσότερα σχετικά με τις διαφορές εξαγωγής DNA.
Γενική εκχύλιση DNA
Εάν επεξεργαστείτε φυτικά και ζωικά κύτταρα με σαπουνάδα, θα υποβαθμίσετε τα λιπίδια στις κυτταρικές και πυρηνικές μεμβράνες. Στη συνέχεια, το μείγμα DNA θα διαχωριστεί από τις κυτταρικές μεμβράνες και τις πρωτεΐνες. Στη συνέχεια, μπορείτε να χρησιμοποιήσετε αλκοόλ για να καταβυθίσετε το DNA στη λύση. Ανάλογα με την ποσότητα στο δείγμα, το DNA μπορεί να είναι ορατό με γυμνό μάτι. Ωστόσο, να έχετε κατά νου ότι αυτή η απλή διαδικασία δεν παράγει απαραίτητα DNA υψηλής καθαρότητας.
Φυτικά και ζωικά κύτταρα
Τα φυτικά κύτταρα διαφέρουν από τα ζωικά κύτταρα λόγω του άκαμπτου κυτταρικού τους τοιχώματος και των οργανιδίων όπως ο χλωροπλάστης. Περιέχουν επίσης πρωτεΐνες και ένζυμα που παίζουν ρόλο στη φωτοσύνθεση. Ορισμένα φυτικά κύτταρα έχουν πολυπλοειδισμό, που σημαίνει ότι έχουν περισσότερα από ένα αντίγραφα από κάθε χρωμόσωμα ανά κύτταρο. Επιπλέον, κυτταρικές διεργασίες που συμβαίνουν σε φυτά όπως η φωτοσύνθεση παράγουν μια σειρά δευτερογενών μεταβολιτών. Τα ζωικά κύτταρα δεν έχουν κυτταρικό τοίχωμα, αλλά εξακολουθούν να χρειάζονται χημικά όπως το δωδεκυλοθειικό νάτριο (SDS) για να διαταράξουν την κυτταρική μεμβράνη για να απελευθερώσουν γονιδιωματικό DNA.
Εκχύλιση DNA φυτών
Το γονιδιωματικό DNA του φυτού είναι πιο δύσκολο να εξαχθεί λόγω του κυτταρικού τοιχώματος του φυτού. Μπορείτε να το αφαιρέσετε με ομογενοποίηση ή με προσθήκη κελλουλάσης για να αποικοδομείτε την κυτταρίνη που αποτελεί το κυτταρικό τοίχωμα. Επιπροσθέτως, οι μεταβολίτες που υπάρχουν στο φυτικό κύτταρο μπορεί να παρεμβαίνουν στην εκχύλιση του γονιδιωματικού ϋΝΑ με μόλυνση του δείγματος ϋΝΑ κατά τη διάρκεια της διαδικασίας καθίζησης.
Έκχυση DNA ζώων
Τα λευκοκύτταρα περιφερικού αίματος είναι η κύρια πηγή του γενωμικού DNA του ζώου, αλλά η συλλογή δειγμάτων είναι δύσκολη επειδή το αίμα πρέπει να προέρχεται απευθείας από το ζώο. Το αίμα περιέχει μια σειρά ενώσεων όπως πρωτεΐνες, λιπίδια, λευκά αιμοσφαίρια, ερυθρά αιμοσφαίρια, αιμοπετάλια και πλάσμα, τα οποία μπορούν να μολύνουν το δείγμα DNA. Ωστόσο, ο πρωταρχικός μολυντής του ζωικού ϋΝΑ που εξάγεται από τα δείγματα αίματος είναι το heme, το οποίο είναι το μη πρωτεϊνικό συστατικό της αιμοσφαιρίνης.
Οι διαφορές στο DNA
Οι διαφορές μεταξύ του DNA των φυτών και των ζώων βρίσκονται στην ακολουθία των βάσεων στην έλικα. Οι ενώσεις που βρίσκονται στα φυτικά κύτταρα απουσιάζουν σε ζωικά κύτταρα και οι αλληλουχίες βάσης DNA αντανακλούν αυτό. Επίσης, το ϋΝΑ γενωμικού φυτού είναι συχνά μεγαλύτερο από το DNA του ζώου. Αυτές οι διαφορές επηρεάζουν επίσης τις μεθόδους εκχύλισης, την απόδοση και την καθαρότητα του DNA.