Περιεχόμενο
Τον 19ο αιώνα, η ταξινόμηση - η ταξινόμηση των ζωντανών οργανισμών - ήταν όλη η οργή στη βιολογία. Τόσο οι ερασιτέχνες όσο και οι επαγγελματίες φυσιοδίφες ήταν τόσο παγιδευμένοι στη μανία της συλλογής και της ταυτοποίησης των πλασμάτων, σπάνια σκαθάρια ήταν καυτά προϊόντα. Εκείνη την εποχή, λίγα ήταν γνωστά για τους μικροοργανισμούς και τη θέση τους στον κόσμο των ζωντανών πραγμάτων, και η ταξινόμηση της μικροβιολογίας δεν έλαβε τόσο μεγάλη προσοχή. Οι παρεμβάσεις δεκαετιών έχουν δει μια δραματική αύξηση της γνώσης των μικροβίων και των μεθόδων αναγνώρισης των μικροοργανισμών, με μέρος αυτής της αύξησης να αποδεικνύεται από την αποτελεσματική ταξινόμηση των μικροοργανισμών.
Συστατικά της ταξινομίας
Η ταξινόμηση έχει τρία στοιχεία: την ονοματολογία, την ταξινόμηση και την ταυτοποίηση. Η ονοματολογία απλώς αναθέτει ένα όνομα σε ένα είδος. Η ταξινόμηση ομαδοποιεί τα είδη σύμφωνα με κοινά χαρακτηριστικά - μερικά από τα οποία είναι φυσικά και κάποια βιοχημικά. Η αναγνώριση χρησιμοποιεί χαρακτηριστικά ενός οργανισμού για να προσδιορίσει το πού ανήκει σε ένα σύστημα ταξινόμησης. Το σύγχρονο ταξινομικό σύστημα έχει ως τη μεγαλύτερη, πιο περιεκτική ομάδα, τους τομείς. Η μικρότερη ομάδα είναι το είδος. Από τα πιο περιεκτικά έως τα πιο συγκεκριμένα, τα επίπεδα τρέχουν έτσι όπως: domain, kingdom, phylum, τάξη, τάξη, οικογένεια, γένος και είδος. Εσείς, για παράδειγμα, είστε η Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Μικροοργανισμοί και Τομείς
Οι μικροοργανισμοί είναι εξαιρετικά διαφορετικοί. Δεν καθορίζονται από κάποιο συγκεκριμένο είδος δομής ή λειτουργίας, αλλά απλά από το μέγεθός τους. Οι μικροοργανισμοί είναι τόσο δύσβατοι που εμπίπτουν στις τρεις διαφορετικές ταξινομήσεις ανώτερου επιπέδου - και στους τρεις τομείς. Ένας τομέας είναι τα βακτήρια, ο άλλος είναι η αρχαία και ο τελικός είναι η ευκαρυά. Όλα τα μέλη των περιοχών των βακτηρίων και των αρχαίων είναι μονόκυκλοι μικροοργανισμοί. Είναι και τα δύο κύτταρα χωρίς μεμβράνες που διαχωρίζουν το γενετικό τους υλικό από το υπόλοιπο των κυττάρων - μεμβράνες που ορίζουν έναν πυρήνα. Έτσι όλα τα βασίλεια, οι φυλές, οι τάξεις, οι τάξεις, οι οικογένειες, τα γένη και τα είδη μέσα στους τομείς των βακτηρίων και των αρχαίων είναι μικροοργανισμοί.
Μονοκυψέλες αντιθέσεις
Οι ευκαρυές είναι οργανισμοί των οποίων τα κύτταρα περιέχουν πυρήνα. Πολλοί ευκαρυωτικοί οργανισμοί είναι μονοκύτταροι μικροοργανισμοί, αλλά πολλοί άλλοι - όπως τα δέντρα redwood ή εσείς - δεν είναι. Επομένως, απαιτούνται πρόσθετες ταξινομήσεις. Το βασίλειο Protista στο πεδίο της Eukarya αποτελείται μόνο από μονοκύτταρους μικροοργανισμούς. Οι protists χωρίζονται σε τρεις διαφορετικές ομάδες phyla: τέσσερις διαφορετικές φυλάδες φυκών, τέσσερις διαφορετικές πρωτόζωες phyla και δύο διαφορετικές phyla μούχλας. Όμως, όλοι οι οργανισμοί μέσα σε αυτές τις φυλές - όλα μέσα στο βασίλειο του Πρωτίστα - είναι μικροοργανισμοί.
Μικροσκοπικοί μύκητες
Το βασίλειο Fungi περιλαμβάνεται στον τομέα Eukarya. Μερικά από τα phyla μέσα στους μύκητες περιέχουν μικροοργανισμούς. Για παράδειγμα, το φυτό Zygomycota περιέχει μικροσκοπικά καλούπια ψωμιού και το φύλλο Ascomycota περιέχει ζύμες και παράσιτα μικροβιακών καλλιεργειών και παράσιτα. Οι λειχήνες είναι μια συμβιωτική συναρμολόγηση ενός μύκητα και ενός φωτοσυνθετικού οργανισμού - που περιέχεται εν μέρει στο βασίλειο των Μύκητων και εν μέρει σε άλλα βασίλεια ή ακόμη και σε άλλους τομείς.